39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1115 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  320  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  83.83 
 
 		 169 aa  253  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  58.06 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  56.03 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  43.67 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  34.36 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  43.67 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  38.22 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  39.26 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  31.33 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  42.07 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  40.91 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  31.54 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  43.56 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  36.31 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  37.21 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  31.61 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  34.13 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  36.48 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  34.55 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  42.34 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  41.23 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  41.44 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  34.4 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  41.44 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  32.72 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  38.85 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  35.26 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  34.57 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  31 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  31.01 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  27.03 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01776  hypothetical protein  28.79 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3367  hypothetical protein  36.2 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01819  hypothetical protein  29.45 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1486  hypothetical protein  36.62 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003860  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  29.88 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>