249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0653 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  100 
 
 		 154 aa  320  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  98.05 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  86.93 
 
 		 155 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  83.12 
 
 		 154 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  83.12 
 
 		 154 aa  273  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  83.12 
 
 		 154 aa  273  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  82.47 
 
 		 154 aa  273  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  81.82 
 
 		 154 aa  270  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  81.82 
 
 		 154 aa  270  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  71.24 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  70.13 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  70.59 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  68.18 
 
 		 165 aa  213  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  66.23 
 
 		 162 aa  209  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  66.23 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  66.01 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  66.01 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  62.99 
 
 		 159 aa  199  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  63.64 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  62.99 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  60 
 
 		 157 aa  188  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  61.29 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  58.71 
 
 		 161 aa  186  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  60.65 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  60 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  60.65 
 
 		 155 aa  183  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  61.94 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  60 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  60 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  60 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  59.35 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  60 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  59.35 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  59.35 
 
 		 155 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  58.71 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  59.35 
 
 		 155 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  61.69 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  56.13 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  57.42 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  56.77 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  58.71 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  55.41 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  54.19 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  52.26 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  53.21 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  51.3 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  52.29 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  49.35 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  49.35 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  49.03 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  50.32 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  45.16 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  47.1 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  45.81 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  45.81 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  49.68 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  44.16 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  47.71 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  46.45 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  46.45 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  46.45 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  48.05 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  47.74 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  46.45 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  45.81 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  45.81 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  45.81 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  45.81 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  45.81 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  45.81 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  47.1 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  46.45 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  47.1 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  44.52 
 
 		 172 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  45.16 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  45.81 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  47.71 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  48.7 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  43.23 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  43.51 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  48.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  43.23 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>