27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1153 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12700  hypothetical protein  95.83 
 
 		 218 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0916578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  47.69 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  45.62 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  44.55 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  45.66 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  44.08 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  43.13 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  43.13 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  47.17 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  30.67 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  26.64 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0441  membrane protein  20.93 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  26.64 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  26.2 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  25.34 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  25.22 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  25.22 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  23.89 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  27.16 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  25.88 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  24.12 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  24.68 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  32.04 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  37.33 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>