38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2404 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  92.31 
 
 		 98 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  84.62 
 
 		 91 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  70.33 
 
 		 97 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  40.86 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  39.77 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  42.53 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  40.23 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  46.94 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  42.42 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  32.93 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11730  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.281094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  27.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2207  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810348  normal  0.0278575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  34.72 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03950  hypothetical protein  34.57 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  33.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  33.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  38.1 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  33.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  42.37 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  33.75 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  28.92 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2419  hypothetical protein  37.5 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  40.68 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  36.92 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  37.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  37.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  37.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1715  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19960  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00655167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1533  hypothetical protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.555679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  30.86 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  38.98 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  30.86 
 
 		 85 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  30.86 
 
 		 85 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49420  hypothetical protein  40.43 
 
 		 103 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>