More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0228 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0243  Serine O-acetyltransferase  99.43 
 
 		 310 aa  353  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250259  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0228  serine O-acetyltransferase, putative  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0252  Serine O-acetyltransferase  98.85 
 
 		 310 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4984  Serine O-acetyltransferase  96.55 
 
 		 310 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0360  Serine O-acetyltransferase  89.14 
 
 		 317 aa  315  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0246  serine O-acetyltransferase  91.12 
 
 		 308 aa  314  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.608547  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5178  serine O-acetyltransferase, putative  88.57 
 
 		 317 aa  314  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0539  Serine O-acetyltransferase  82.93 
 
 		 308 aa  288  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0026  Serine O-acetyltransferase  82.82 
 
 		 322 aa  286  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602899  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2495  Serine O-acetyltransferase  77.91 
 
 		 256 aa  279  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20980  Serine O-acetyltransferase  81.44 
 
 		 327 aa  278  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2970  Serine O-acetyltransferase  77.84 
 
 		 304 aa  277  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2625  Serine O-acetyltransferase  78.36 
 
 		 312 aa  275  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4004  Serine O-acetyltransferase  77.78 
 
 		 312 aa  273  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3514  Serine O-acetyltransferase  77.78 
 
 		 312 aa  273  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2551  Serine O-acetyltransferase  79.04 
 
 		 303 aa  273  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1891  Serine O-acetyltransferase  77.25 
 
 		 304 aa  272  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1908  Serine acetyltransferase  78.66 
 
 		 329 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0451  putative serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 329 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0365  serine acetyltransferase  78.66 
 
 		 275 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1821  putative serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 329 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5789  Serine O-acetyltransferase  73.1 
 
 		 304 aa  265  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00634534 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0196  putative serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 329 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.98649  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1411  putative serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 329 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0930  putative serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 275 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1194  putative serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 307 aa  264  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0051  putative serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 307 aa  264  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0049  putative serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 307 aa  264  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2419  Serine O-acetyltransferase  76.97 
 
 		 314 aa  264  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.241521 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1478  putative serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 307 aa  264  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0041  putative serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 340 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0062  serine acetyltransferase, plasmid  74.27 
 
 		 307 aa  263  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1547  serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 340 aa  263  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0121  Serine O-acetyltransferase  77.44 
 
 		 327 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1555  Serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 325 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0041  serine O-acetyltransferase  74.27 
 
 		 355 aa  262  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572277  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2663  putative serine acetyltransferase  75.45 
 
 		 319 aa  261  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125772  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0615  Serine O-acetyltransferase  78.05 
 
 		 317 aa  260  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2073  Serine O-acetyltransferase  75.88 
 
 		 305 aa  259  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4451  Serine O-acetyltransferase  72.09 
 
 		 310 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5293  Serine O-acetyltransferase  74.55 
 
 		 306 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5012  Serine O-acetyltransferase  74.55 
 
 		 306 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3153  Serine O-acetyltransferase  74.55 
 
 		 306 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5118  Serine O-acetyltransferase  73.94 
 
 		 306 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4482  Serine O-acetyltransferase  73.94 
 
 		 306 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5741  Serine O-acetyltransferase  73.94 
 
 		 306 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732897  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3134  Serine O-acetyltransferase  73.94 
 
 		 306 aa  253  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4420  Serine O-acetyltransferase  76.05 
 
 		 324 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.831847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4287  Serine O-acetyltransferase  73.33 
 
 		 308 aa  250  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.241977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3638  Serine O-acetyltransferase  71.18 
 
 		 315 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0265685  normal  0.117045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0616  Serine O-acetyltransferase  72.12 
 
 		 308 aa  245  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0555291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3294  serine O-acetyltransferase  72.46 
 
 		 319 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.169765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3226  Serine O-acetyltransferase  70.55 
 
 		 316 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.891655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5016  Serine O-acetyltransferase  68.26 
 
 		 302 aa  235  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0756  Serine O-acetyltransferase  68.1 
 
 		 314 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.529744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2676  Serine O-acetyltransferase  64.85 
 
 		 312 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2580  Serine O-acetyltransferase  64.85 
 
 		 312 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1609  Serine O-acetyltransferase  70.83 
 
 		 315 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1281  serine O-acetyltransferase  64.85 
 
 		 312 aa  228  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3081  Serine O-acetyltransferase  67.08 
 
 		 321 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2486  Serine O-acetyltransferase  66.67 
 
 		 313 aa  225  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.478214  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1261  putative serine acetyltransferase  66.46 
 
 		 296 aa  221  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0279  Serine O-acetyltransferase  63.98 
 
 		 303 aa  221  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2657  Serine O-acetyltransferase  66.46 
 
 		 317 aa  221  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1637  Serine O-acetyltransferase  64.15 
 
 		 297 aa  214  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.432308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2298  Serine O-acetyltransferase  62.73 
 
 		 323 aa  214  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1383  Serine O-acetyltransferase  62.73 
 
 		 293 aa  210  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0414  Serine O-acetyltransferase  55.43 
 
 		 320 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0438  Serine O-acetyltransferase  57.32 
 
 		 284 aa  197  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.150955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2427  Serine O-acetyltransferase  61.39 
 
 		 312 aa  194  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2682  Serine O-acetyltransferase  58.13 
 
 		 318 aa  190  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3212  Serine O-acetyltransferase  62.11 
 
 		 335 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0060909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1307  Serine O-acetyltransferase  58.39 
 
 		 311 aa  182  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0685  serine O-acetyltransferase  58.44 
 
 		 297 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2376  Serine O-acetyltransferase  54.78 
 
 		 287 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0112476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0243  Serine O-acetyltransferase  57.79 
 
 		 277 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2363  Serine O-acetyltransferase  55.62 
 
 		 270 aa  168  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.132586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2236  Serine O-acetyltransferase  53.42 
 
 		 314 aa  167  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0301584  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22670  serine acetyltransferase  52.1 
 
 		 306 aa  165  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.702952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2505  Serine O-acetyltransferase  55 
 
 		 263 aa  165  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.729249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1821  Serine O-acetyltransferase  56 
 
 		 280 aa  165  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1590  Serine O-acetyltransferase  56.49 
 
 		 281 aa  164  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6439  Serine O-acetyltransferase  53.75 
 
 		 271 aa  160  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101352  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10990  serine acetyltransferase  48.82 
 
 		 304 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2710  Serine O-acetyltransferase  51.85 
 
 		 240 aa  159  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3971  Serine O-acetyltransferase  54.04 
 
 		 290 aa  156  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4975  Serine O-acetyltransferase  53.42 
 
 		 290 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.593297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  52.26 
 
 		 258 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  51.9 
 
 		 221 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  52.26 
 
 		 258 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1816  serine acetyltransferase  52.26 
 
 		 287 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  49.69 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  50.97 
 
 		 261 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  49.69 
 
 		 258 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  54.25 
 
 		 241 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  51.61 
 
 		 261 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  51.61 
 
 		 261 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  50 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  53.9 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  50 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>