More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4420 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4420  Serine O-acetyltransferase  100 
 
 
324 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.831847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20980  Serine O-acetyltransferase  60.86 
 
 
327 aa  360  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5178  serine O-acetyltransferase, putative  61.56 
 
 
317 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0246  serine O-acetyltransferase  62.75 
 
 
308 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.608547  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0360  Serine O-acetyltransferase  60.91 
 
 
317 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0539  Serine O-acetyltransferase  59.46 
 
 
308 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0026  Serine O-acetyltransferase  58.19 
 
 
322 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602899  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4984  Serine O-acetyltransferase  62.38 
 
 
310 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5789  Serine O-acetyltransferase  60.75 
 
 
304 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2970  Serine O-acetyltransferase  58.97 
 
 
304 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0252  Serine O-acetyltransferase  61.39 
 
 
310 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277329  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0243  Serine O-acetyltransferase  61.39 
 
 
310 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250259  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0756  Serine O-acetyltransferase  55.22 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.529744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1891  Serine O-acetyltransferase  58.08 
 
 
304 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1555  Serine O-acetyltransferase  58.78 
 
 
325 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2551  Serine O-acetyltransferase  58.97 
 
 
303 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0121  Serine O-acetyltransferase  57.58 
 
 
327 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2625  Serine O-acetyltransferase  60 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2419  Serine O-acetyltransferase  59.66 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.241521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4004  Serine O-acetyltransferase  59.86 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3514  Serine O-acetyltransferase  59.86 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3153  Serine O-acetyltransferase  56.86 
 
 
306 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0615  Serine O-acetyltransferase  56.86 
 
 
317 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4482  Serine O-acetyltransferase  56.19 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5293  Serine O-acetyltransferase  56.86 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5118  Serine O-acetyltransferase  56.19 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5012  Serine O-acetyltransferase  56.19 
 
 
306 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5741  Serine O-acetyltransferase  56.19 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732897  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3134  Serine O-acetyltransferase  56.19 
 
 
306 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1908  Serine acetyltransferase  57.53 
 
 
329 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0451  putative serine O-acetyltransferase  57.19 
 
 
329 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1411  putative serine O-acetyltransferase  57.19 
 
 
329 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0196  putative serine O-acetyltransferase  57.19 
 
 
329 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.98649  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1194  putative serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
307 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0051  putative serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
307 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1478  putative serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
307 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0049  putative serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
307 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0041  putative serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
340 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1547  serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
340 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1821  putative serine O-acetyltransferase  57.19 
 
 
329 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0062  serine acetyltransferase, plasmid  56.36 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0041  serine O-acetyltransferase  56.36 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2073  Serine O-acetyltransferase  57.68 
 
 
305 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3638  Serine O-acetyltransferase  54.52 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0265685  normal  0.117045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4451  Serine O-acetyltransferase  54.66 
 
 
310 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.545149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0616  Serine O-acetyltransferase  55.29 
 
 
308 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0555291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4287  Serine O-acetyltransferase  56.01 
 
 
308 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.241977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3294  serine O-acetyltransferase  56.16 
 
 
319 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.169765 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2663  putative serine acetyltransferase  52.33 
 
 
319 aa  293  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125772  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3226  Serine O-acetyltransferase  54.45 
 
 
316 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.891655  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1609  Serine O-acetyltransferase  53.18 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2495  Serine O-acetyltransferase  57.66 
 
 
256 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0365  serine acetyltransferase  62.24 
 
 
275 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833378  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0930  putative serine O-acetyltransferase  61.83 
 
 
275 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5016  Serine O-acetyltransferase  48.46 
 
 
302 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3081  Serine O-acetyltransferase  51.07 
 
 
321 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2676  Serine O-acetyltransferase  52.85 
 
 
312 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1281  serine O-acetyltransferase  51.29 
 
 
312 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2580  Serine O-acetyltransferase  52.85 
 
 
312 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1637  Serine O-acetyltransferase  47.96 
 
 
297 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.432308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2298  Serine O-acetyltransferase  46.75 
 
 
323 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2486  Serine O-acetyltransferase  55.47 
 
 
313 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.478214  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2657  Serine O-acetyltransferase  47.99 
 
 
317 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0228  serine O-acetyltransferase, putative  76.05 
 
 
174 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0279  Serine O-acetyltransferase  50.74 
 
 
303 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1383  Serine O-acetyltransferase  47.23 
 
 
293 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1261  putative serine acetyltransferase  49.17 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2427  Serine O-acetyltransferase  45.72 
 
 
312 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0438  Serine O-acetyltransferase  51.11 
 
 
284 aa  206  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.150955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3212  Serine O-acetyltransferase  47.78 
 
 
335 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0060909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2682  Serine O-acetyltransferase  45.95 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0414  Serine O-acetyltransferase  43.19 
 
 
320 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22670  serine acetyltransferase  43.63 
 
 
306 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.702952 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2236  Serine O-acetyltransferase  42.28 
 
 
314 aa  195  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0301584  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2363  Serine O-acetyltransferase  43.87 
 
 
270 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.132586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1307  Serine O-acetyltransferase  57.93 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0685  serine O-acetyltransferase  43.41 
 
 
297 aa  189  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10990  serine acetyltransferase  41.02 
 
 
304 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2376  Serine O-acetyltransferase  45.32 
 
 
287 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0112476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0243  Serine O-acetyltransferase  41.31 
 
 
277 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2710  Serine O-acetyltransferase  42.22 
 
 
240 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6439  Serine O-acetyltransferase  48.29 
 
 
271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101352  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1821  Serine O-acetyltransferase  42.19 
 
 
280 aa  165  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1590  Serine O-acetyltransferase  41.96 
 
 
281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3971  Serine O-acetyltransferase  50.57 
 
 
290 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4975  Serine O-acetyltransferase  42.15 
 
 
290 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.593297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2505  Serine O-acetyltransferase  45.5 
 
 
263 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.729249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1816  serine acetyltransferase  44.28 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2038  Serine O-acetyltransferase  37.76 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.963984  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  46.6 
 
 
249 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  48.54 
 
 
258 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  46.28 
 
 
258 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  43.46 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  49.7 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  46.51 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  48.15 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  44.91 
 
 
221 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  43.62 
 
 
258 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  45.21 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  47.88 
 
 
222 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>