More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4984 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4984  Serine O-acetyltransferase  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0243  Serine O-acetyltransferase  93.87 
 
 
310 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250259  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0252  Serine O-acetyltransferase  94.19 
 
 
310 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.277329  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0246  serine O-acetyltransferase  83.93 
 
 
308 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.608547  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0360  Serine O-acetyltransferase  83.28 
 
 
317 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5178  serine O-acetyltransferase, putative  82.3 
 
 
317 aa  500  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20980  Serine O-acetyltransferase  71.57 
 
 
327 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0026  Serine O-acetyltransferase  71.28 
 
 
322 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602899  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0539  Serine O-acetyltransferase  69.33 
 
 
308 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2551  Serine O-acetyltransferase  71.77 
 
 
303 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2970  Serine O-acetyltransferase  69.59 
 
 
304 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1891  Serine O-acetyltransferase  68.11 
 
 
304 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2625  Serine O-acetyltransferase  69.87 
 
 
312 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4004  Serine O-acetyltransferase  68.87 
 
 
312 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3514  Serine O-acetyltransferase  68.87 
 
 
312 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5789  Serine O-acetyltransferase  64 
 
 
304 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00634534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1555  Serine O-acetyltransferase  69.07 
 
 
325 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1821  putative serine O-acetyltransferase  67.58 
 
 
329 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0121  Serine O-acetyltransferase  68.26 
 
 
327 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1908  Serine acetyltransferase  67.69 
 
 
329 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0451  putative serine O-acetyltransferase  67.35 
 
 
329 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0196  putative serine O-acetyltransferase  67.35 
 
 
329 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.98649  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1411  putative serine O-acetyltransferase  67.35 
 
 
329 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4420  Serine O-acetyltransferase  62.38 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.831847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2495  Serine O-acetyltransferase  70.8 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0041  serine O-acetyltransferase  60.2 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4482  Serine O-acetyltransferase  59.21 
 
 
306 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0062  serine acetyltransferase, plasmid  59.53 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0051  putative serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1194  putative serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1478  putative serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0049  putative serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0041  putative serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
340 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1547  serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
340 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5118  Serine O-acetyltransferase  59.21 
 
 
306 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5741  Serine O-acetyltransferase  59.21 
 
 
306 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732897  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0615  Serine O-acetyltransferase  63.95 
 
 
317 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3153  Serine O-acetyltransferase  58.88 
 
 
306 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5012  Serine O-acetyltransferase  58.88 
 
 
306 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3134  Serine O-acetyltransferase  58.88 
 
 
306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5293  Serine O-acetyltransferase  58.88 
 
 
306 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4451  Serine O-acetyltransferase  59.53 
 
 
310 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.545149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0228  serine O-acetyltransferase, putative  96.55 
 
 
174 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4287  Serine O-acetyltransferase  58.22 
 
 
308 aa  341  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.241977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0616  Serine O-acetyltransferase  58.78 
 
 
308 aa  338  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0555291 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0365  serine acetyltransferase  72.73 
 
 
275 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833378  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0930  putative serine O-acetyltransferase  72.31 
 
 
275 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2073  Serine O-acetyltransferase  61.22 
 
 
305 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2419  Serine O-acetyltransferase  59.4 
 
 
314 aa  332  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.241521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0756  Serine O-acetyltransferase  55.67 
 
 
314 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.529744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3638  Serine O-acetyltransferase  58.31 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0265685  normal  0.117045 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2663  putative serine acetyltransferase  58.53 
 
 
319 aa  322  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125772  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3226  Serine O-acetyltransferase  56.61 
 
 
316 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.891655  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1609  Serine O-acetyltransferase  57 
 
 
315 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3294  serine O-acetyltransferase  56.46 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.169765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2676  Serine O-acetyltransferase  54.2 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2580  Serine O-acetyltransferase  54.2 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1281  serine O-acetyltransferase  54.2 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5016  Serine O-acetyltransferase  51.49 
 
 
302 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2486  Serine O-acetyltransferase  54.68 
 
 
313 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.478214  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3081  Serine O-acetyltransferase  52.33 
 
 
321 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1383  Serine O-acetyltransferase  49.81 
 
 
293 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2298  Serine O-acetyltransferase  50.19 
 
 
323 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1637  Serine O-acetyltransferase  49.62 
 
 
297 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.432308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1261  putative serine acetyltransferase  49.27 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0279  Serine O-acetyltransferase  47.89 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2657  Serine O-acetyltransferase  50.39 
 
 
317 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0414  Serine O-acetyltransferase  45.14 
 
 
320 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2682  Serine O-acetyltransferase  45.59 
 
 
318 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2427  Serine O-acetyltransferase  47.91 
 
 
312 aa  219  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0438  Serine O-acetyltransferase  43.85 
 
 
284 aa  216  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.150955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3212  Serine O-acetyltransferase  49.44 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0060909 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22670  serine acetyltransferase  43.07 
 
 
306 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.702952 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2236  Serine O-acetyltransferase  42.6 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0301584  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1307  Serine O-acetyltransferase  45.45 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10990  serine acetyltransferase  41.54 
 
 
304 aa  196  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2376  Serine O-acetyltransferase  43.02 
 
 
287 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0112476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2363  Serine O-acetyltransferase  42.59 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.132586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0685  serine O-acetyltransferase  55.23 
 
 
297 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0243  Serine O-acetyltransferase  41.95 
 
 
277 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1821  Serine O-acetyltransferase  48.73 
 
 
280 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1590  Serine O-acetyltransferase  41.33 
 
 
281 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2505  Serine O-acetyltransferase  43.32 
 
 
263 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.729249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3971  Serine O-acetyltransferase  43.3 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4975  Serine O-acetyltransferase  43.18 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.593297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6439  Serine O-acetyltransferase  42.31 
 
 
271 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101352  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2710  Serine O-acetyltransferase  49.45 
 
 
240 aa  169  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1816  serine acetyltransferase  47.21 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  49.4 
 
 
221 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  50.93 
 
 
258 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  48.47 
 
 
258 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  50.93 
 
 
258 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2038  Serine O-acetyltransferase  45.69 
 
 
269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.963984  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  48.77 
 
 
258 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  51.55 
 
 
241 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  50 
 
 
261 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  47.9 
 
 
239 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1244  serine O-acetyltransferase  46.7 
 
 
292 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000603687  normal  0.0426747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  46.99 
 
 
222 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  46.39 
 
 
229 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>