19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66353 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  100 
 
 		 591 aa  1208    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  33.55 
 
 		 665 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  33.82 
 
 		 806 aa  124  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  31.77 
 
 		 732 aa  109  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  29.5 
 
 		 1067 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  29.9 
 
 		 1151 aa  94  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  29.44 
 
 		 1191 aa  88.2  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  28.77 
 
 		 1100 aa  80.5  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  31.71 
 
 		 906 aa  74.3  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  29.02 
 
 		 1411 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02710  Rho GTPase activator, putative  27.23 
 
 		 1296 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44196  bud-emergence protein  27.4 
 
 		 1747 aa  58.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07576  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  23.28 
 
 		 1201 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.230213  normal  0.583804 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  26.32 
 
 		 1562 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  28.57 
 
 		 1236 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  31.43 
 
 		 644 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  25.46 
 
 		 464 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  23.53 
 
 		 1119 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  24.18 
 
 		 625 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>