13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54632 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  100 
 
 		 591 aa  1216    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.397245 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  26.02 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  21.73 
 
 		 493 aa  98.2  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  25.93 
 
 		 738 aa  60.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547553 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03560  hypothetical protein  20.68 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  29.17 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80446  protein involved in Golgi retention and vacuolar sorting  27.16 
 
 		 684 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.914331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  29.77 
 
 		 458 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.192095 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  29.29 
 
 		 898 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  32.47 
 
 		 392 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  31.09 
 
 		 142 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  29.82 
 
 		 144 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  30 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>