24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44442 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_44442  predicted protein  100 
 
 
443 aa  912    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47288  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 
467 aa  242  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.451932  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  31.23 
 
 
491 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46178  predicted protein  30.86 
 
 
445 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00570  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
634 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351381  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54974  hydrolase  26.55 
 
 
494 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29727  predicted protein  22.96 
 
 
511 aa  69.7  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  22.67 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
330 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
330 aa  47  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1863  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.302111  normal  0.224548 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  30.77 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.85 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.26 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.85 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
293 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
309 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.29 
 
 
278 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52018  predicted protein  30.61 
 
 
660 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
831 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
297 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
297 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>