24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28619 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01093  mitochondrial dynamin GTPase (Msp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11970)  54.18 
 
 
909 aa  793    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28619  mitochondrial dynamin-like GTPase  100 
 
 
856 aa  1758    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222715  normal  0.433771 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05070  dynamin GTPase, putative  44.22 
 
 
933 aa  606  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01680  dynamin protein dnm1, putative  40.38 
 
 
832 aa  184  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08874  dynamin-like GTPase Dnm1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02840)  39.86 
 
 
794 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362434  hitchhiker  0.000218966 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08023  Putative uncharacterized proteinVpsA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X230]  38.97 
 
 
696 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0172951 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05470  VpsA, putative  37.16 
 
 
694 aa  177  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73603  predicted protein  36.56 
 
 
693 aa  174  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.163855  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29011  predicted protein  34.71 
 
 
703 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.453341  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54751  predicted protein  35.03 
 
 
742 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29756  predicted protein  37.45 
 
 
822 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500789  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10691  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11890)  29.96 
 
 
735 aa  88.2  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.999166 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05327  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 
739 aa  84.7  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01309  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G08580)  23.99 
 
 
717 aa  79  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.914788 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01912  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07630)  24.32 
 
 
829 aa  78.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0996086 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14771  predicted protein  29.22 
 
 
285 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229039  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31402  predicted protein  27.6 
 
 
900 aa  64.3  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0818576  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33467  predicted protein  27.83 
 
 
853 aa  61.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.24736  normal  0.0311419 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21455  predicted protein  26.92 
 
 
815 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00534  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
191 aa  51.6  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  28.57 
 
 
610 aa  48.5  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  35.35 
 
 
679 aa  47.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.32 
 
 
548 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  31.01 
 
 
888 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>