20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29756 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_08874  dynamin-like GTPase Dnm1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02840)  56.17 
 
 
794 aa  864    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362434  hitchhiker  0.000218966 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01680  dynamin protein dnm1, putative  51.29 
 
 
832 aa  780    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29756  predicted protein  100 
 
 
822 aa  1694    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500789  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05470  VpsA, putative  47.08 
 
 
694 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08023  Putative uncharacterized proteinVpsA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X230]  47.26 
 
 
696 aa  513  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0172951 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54751  predicted protein  46.08 
 
 
742 aa  511  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73603  predicted protein  45.77 
 
 
693 aa  508  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.163855  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29011  predicted protein  40.73 
 
 
703 aa  428  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.453341  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05070  dynamin GTPase, putative  28.06 
 
 
933 aa  174  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01093  mitochondrial dynamin GTPase (Msp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11970)  34.72 
 
 
909 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28619  mitochondrial dynamin-like GTPase  37.45 
 
 
856 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222715  normal  0.433771 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05327  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 
739 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14771  predicted protein  34.25 
 
 
285 aa  109  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229039  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01309  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G08580)  27.67 
 
 
717 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.914788 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10691  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11890)  26.6 
 
 
735 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.999166 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33467  predicted protein  23.55 
 
 
853 aa  85.1  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.24736  normal  0.0311419 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01912  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07630)  27.6 
 
 
829 aa  84.3  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0996086 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01648  conserved hypothetical protein  32.68 
 
 
417 aa  82  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31402  predicted protein  25.22 
 
 
900 aa  62  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0818576  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21455  predicted protein  24.76 
 
 
815 aa  54.3  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>