22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01680 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_08874  dynamin-like GTPase Dnm1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02840)  56.25 
 
 
794 aa  855    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362434  hitchhiker  0.000218966 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29756  predicted protein  51.23 
 
 
822 aa  783    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500789  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01680  dynamin protein dnm1, putative  100 
 
 
832 aa  1700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08023  Putative uncharacterized proteinVpsA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X230]  50.91 
 
 
696 aa  536  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0172951 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05470  VpsA, putative  50.18 
 
 
694 aa  535  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73603  predicted protein  49.91 
 
 
693 aa  525  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.163855  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54751  predicted protein  49.02 
 
 
742 aa  520  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29011  predicted protein  44.06 
 
 
703 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.453341  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01093  mitochondrial dynamin GTPase (Msp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11970)  44.84 
 
 
909 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05070  dynamin GTPase, putative  31.19 
 
 
933 aa  184  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28619  mitochondrial dynamin-like GTPase  40.38 
 
 
856 aa  184  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222715  normal  0.433771 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05327  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 
739 aa  141  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14771  predicted protein  33.5 
 
 
285 aa  114  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229039  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10691  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11890)  27.68 
 
 
735 aa  110  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.999166 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01912  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07630)  27.11 
 
 
829 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0996086 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01309  dynamin GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G08580)  29.7 
 
 
717 aa  105  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33467  predicted protein  26.12 
 
 
853 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.24736  normal  0.0311419 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01648  conserved hypothetical protein  40.13 
 
 
417 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31402  predicted protein  27.8 
 
 
900 aa  72  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0818576  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21455  predicted protein  26.69 
 
 
815 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00534  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 
191 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01322  dynamin family GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14300)  21.9 
 
 
743 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>