57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46995 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_46995  predicted protein  100 
 
 		 420 aa  882    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  30.81 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.95 
 
 		 186 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  28.79 
 
 		 196 aa  54.3  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  30.82 
 
 		 211 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.19 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  27.54 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  25.24 
 
 		 197 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  27.54 
 
 		 191 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.63 
 
 		 201 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.36 
 
 		 197 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  25.12 
 
 		 203 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  25.63 
 
 		 191 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.161215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  25.12 
 
 		 203 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  25.12 
 
 		 203 aa  49.7  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.02 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  26.19 
 
 		 188 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 187 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 187 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.5 
 
 		 197 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  27.72 
 
 		 190 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25 
 
 		 187 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  25.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  25.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  25.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  25.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  25.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.71 
 
 		 188 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  36.47 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.26 
 
 		 189 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  24.02 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.81 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  28.03 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25 
 
 		 189 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  23.39 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  25.24 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  24.88 
 
 		 188 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  26.37 
 
 		 190 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  27.41 
 
 		 183 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  25.24 
 
 		 188 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  24.14 
 
 		 199 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  24.02 
 
 		 188 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 187 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  25.51 
 
 		 187 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.4 
 
 		 196 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  28.12 
 
 		 200 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  23.27 
 
 		 188 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  24.26 
 
 		 207 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  23.27 
 
 		 188 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  23.27 
 
 		 188 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  23.27 
 
 		 188 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  26.02 
 
 		 199 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>