More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0531 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  100 
 
 
647 aa  1355    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  50.62 
 
 
642 aa  673    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  51.54 
 
 
645 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  48.4 
 
 
647 aa  629  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  48.41 
 
 
635 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  48.41 
 
 
635 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  47.6 
 
 
652 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  46.3 
 
 
644 aa  595  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  45.59 
 
 
676 aa  572  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  44.86 
 
 
686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  44.99 
 
 
682 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  43.98 
 
 
692 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  44.66 
 
 
716 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  42.75 
 
 
704 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  44.53 
 
 
685 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  41.79 
 
 
714 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  42.92 
 
 
689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  43.65 
 
 
690 aa  515  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  42.61 
 
 
691 aa  512  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  42.56 
 
 
678 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  43.5 
 
 
690 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  43.71 
 
 
683 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  41.41 
 
 
687 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  43.05 
 
 
690 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  41.79 
 
 
681 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  41.82 
 
 
686 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  42.07 
 
 
684 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  42.66 
 
 
681 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  41.34 
 
 
679 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  40.48 
 
 
678 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  42.11 
 
 
802 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  40.9 
 
 
680 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  41.64 
 
 
680 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  41.49 
 
 
699 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  40.98 
 
 
679 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.43 
 
 
682 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  41.02 
 
 
680 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  41.02 
 
 
680 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  41.02 
 
 
680 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  40.12 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  41.49 
 
 
679 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  39.25 
 
 
738 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  37.06 
 
 
846 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  39.29 
 
 
600 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  36.09 
 
 
650 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  28.62 
 
 
573 aa  206  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  28.5 
 
 
583 aa  200  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  27.01 
 
 
587 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.9 
 
 
576 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.9 
 
 
576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  27.83 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.48 
 
 
686 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.09 
 
 
566 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.26 
 
 
566 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.54 
 
 
626 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.77 
 
 
574 aa  172  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.48 
 
 
700 aa  171  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  26.66 
 
 
546 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  27.5 
 
 
564 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.03 
 
 
577 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.21 
 
 
542 aa  167  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  27.03 
 
 
567 aa  166  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.21 
 
 
542 aa  166  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  25.99 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  27.09 
 
 
538 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.05 
 
 
566 aa  165  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  26.89 
 
 
658 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.66 
 
 
567 aa  163  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  26.4 
 
 
571 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.66 
 
 
567 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  25.12 
 
 
561 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  25.12 
 
 
561 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  26.63 
 
 
550 aa  158  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.26 
 
 
577 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.8 
 
 
540 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  25.75 
 
 
571 aa  156  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  26.88 
 
 
543 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  24.42 
 
 
566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  27.23 
 
 
554 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  27.34 
 
 
554 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  25.32 
 
 
540 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  25.32 
 
 
540 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  25.97 
 
 
547 aa  153  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  27.35 
 
 
552 aa  153  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  24.92 
 
 
561 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  25.32 
 
 
540 aa  153  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  25.2 
 
 
540 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.14 
 
 
556 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  27.39 
 
 
554 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  24.45 
 
 
688 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  25.24 
 
 
544 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.39 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  25.91 
 
 
562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  25 
 
 
543 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  25.24 
 
 
545 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  25 
 
 
561 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  26.01 
 
 
577 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  24.8 
 
 
567 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  24.83 
 
 
561 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  25.4 
 
 
558 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>