14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3309 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3309  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336763  normal  0.317543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0876  Tetratricopeptide domain protein  54.11 
 
 		 307 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4988  TPR repeat-containing protein  50.33 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1683  TPR repeat-containing protein  48 
 
 		 310 aa  285  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3748  tetratricopeptide TPR_2  43.94 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2566  TPR repeat-containing protein  39.37 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0561  hypothetical protein  40.38 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0301801 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 458 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 2262 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 2262 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 461 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  22.12 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 4079 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>