15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0876 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0876  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3309  tetratricopeptide TPR_2  54.11 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2808  hypothetical protein  54.11 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336763  normal  0.317543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1683  TPR repeat-containing protein  46.94 
 
 		 310 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4988  TPR repeat-containing protein  47.4 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3748  tetratricopeptide TPR_2  45.1 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2566  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.841718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0561  hypothetical protein  41.32 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0301801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2131  outer membrane protein  31.9 
 
 		 822 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2141  outer membrane protein  31.9 
 
 		 822 aa  49.3  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.115838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2241  outer membrane protein  31.9 
 
 		 824 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 662 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1276 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.37 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>