30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0598 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  100 
 
 		 407 aa  837    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  100 
 
 		 407 aa  837    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  72.52 
 
 		 404 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  67.94 
 
 		 409 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  62.37 
 
 		 429 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  49.49 
 
 		 412 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  51.17 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  44.08 
 
 		 249 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  46.55 
 
 		 256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 245 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  43.22 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  40.42 
 
 		 239 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 254 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 254 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 238 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  25.67 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.85 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  29.13 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 		 279 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.86 
 
 		 289 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  23.6 
 
 		 268 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 289 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 		 266 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.30636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.83 
 
 		 244 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.54 
 
 		 268 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0330322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 258 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 245 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>