13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2879 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  407  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  41.08 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  40.54 
 
 		 188 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  38.95 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  36.57 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  29.68 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  31.5 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  27.78 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  31.09 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  26.4 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  25.73 
 
 		 388 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>