16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  203  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  92.52 
 
 		 107 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  42.53 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  40.43 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4370  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  40.62 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  42.11 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  37.63 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4236  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  37.18 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  35.24 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03808  hypothetical protein  40.3 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0948  hypothetical protein  39.29 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>