13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3293  fimbrial protein  32.94 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0241788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  35.35 
 
 		 180 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  29.25 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  26.19 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.27 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  38 
 
 		 176 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6686  fimbrial protein  26.71 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  25.09 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  29.41 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  24.31 
 
 		 180 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  28.57 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3015  fimbrial protein  24.05 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>