17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21111 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  100 
 
 
187 aa  350  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  62.78 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  59.02 
 
 
209 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  56.83 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  58.47 
 
 
210 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  56.15 
 
 
204 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  57.07 
 
 
210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  37.97 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  36.71 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  40.85 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  41.56 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  33.17 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  34.9 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  38.21 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  32.03 
 
 
211 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3374  hypothetical protein  39.39 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215673  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  34.23 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>