58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1161 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1161  protein of unknown function DUF883 ElaB  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  40 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.63 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  33.68 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  32.63 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  32.63 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  32.63 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  32.63 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  32.63 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.68 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  34.74 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  35.79 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  32.41 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.58 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1445  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.17 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.91 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.18 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  30.77 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  26.17 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0060  hypothetical protein  30.85 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.53 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  28 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  28 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1185  hypothetical protein  26.32 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.81082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0703  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.45 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531721  normal  0.133023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  29.59 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0769  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.45 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.754724  normal  0.0525304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2171  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.73 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  29.9 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  29.9 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  31 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  28.87 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0753  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.286426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  31 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  31 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  26.85 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.72 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  24.24 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  26.85 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  28 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47130  hypothetical protein  28.87 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4067  hypothetical protein  28.87 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2655  hypothetical protein  37.36 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1241  protein of unknown function DUF883 ElaB  37.5 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00670421  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.6 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0803  hypothetical protein  35.19 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>