145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0753 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0753  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.286426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0769  protein of unknown function DUF883 ElaB  96.3 
 
 
130 aa  185  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.754724  normal  0.0525304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0703  protein of unknown function DUF883 ElaB  96.3 
 
 
130 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531721  normal  0.133023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  73.2 
 
 
100 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  73.2 
 
 
100 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  73.2 
 
 
100 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  73.2 
 
 
100 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2655  hypothetical protein  94.51 
 
 
91 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  72.16 
 
 
100 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  72.16 
 
 
100 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  71.13 
 
 
100 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  70.1 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  70.1 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  71.13 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  70.1 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  70.1 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  70.1 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  70.1 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  70.1 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0803  hypothetical protein  92.63 
 
 
108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680665  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  69.07 
 
 
100 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  65.98 
 
 
100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  65.98 
 
 
100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  52.83 
 
 
114 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  57.29 
 
 
104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  53.12 
 
 
103 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  50 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2238  protein of unknown function DUF883, ElaB  47.96 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1647  protein of unknown function DUF883 ElaB  47.37 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266219  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  46.32 
 
 
104 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  46.32 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  45.26 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  46.32 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1185  hypothetical protein  43.62 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.81082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2334  hypothetical protein  44.21 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2118  hypothetical protein  44.21 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.365861  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0060  hypothetical protein  44.12 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0015  putative transmembrane protein  37.04 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0870168  normal  0.721209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3000  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.54 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.876855  hitchhiker  0.0000209502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  37.76 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28490  hypothetical protein  34.74 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2485  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2568  hypothetical protein  36.79 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3430  protein of unknown function DUF883 ElaB  40 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468728  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18990  hypothetical protein  37.89 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3390  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.73 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3174  hypothetical protein  33.02 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.71 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3039  hypothetical protein  34.74 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000238513  normal  0.059368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.78 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  32.71 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0741  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.71 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3586  hypothetical protein  29.79 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.216587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3524  hypothetical protein  29.79 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3420  hypothetical protein  29.79 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3417  hypothetical protein  29.79 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3490  hypothetical protein  29.79 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0523  hypothetical protein  28.71 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02967  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0603  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3263  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3552  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.71 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.674047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4413  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.319782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3286  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3571  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0598  protein of unknown function DUF883 ElaB  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.946971  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3396  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02918  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3516  protein of unknown function DUF883 ElaB  25.74 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.71 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47130  hypothetical protein  35.16 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4067  hypothetical protein  34.44 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1479  hypothetical protein  32.5 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1788  hypothetical protein  32.5 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.963476  normal  0.212883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1585  protein of unknown function DUF883 ElaB  32.5 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  28.72 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  28.72 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.72 
 
 
101 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0971  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.06 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3718  protein of unknown function DUF883 ElaB  30.61 
 
 
102 aa  52  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3548  protein of unknown function DUF883, ElaB  30.86 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1813  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.25 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2189  hypothetical protein  30.86 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3595  protein of unknown function DUF883 ElaB  31.87 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0038891  hitchhiker  0.000000142788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0362  putative membrane protein, ElaB-like  30.77 
 
 
126 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0678074  normal  0.0886926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00240  hypothetical protein  26.8 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1445  protein of unknown function DUF883, ElaB  26.6 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2791  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.96 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2792  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2447  hypothetical protein  30.77 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.653113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1011  protein of unknown function DUF883 ElaB  29.17 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3207  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3914  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0162  protein of unknown function DUF883 ElaB  39.34 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.28952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1938  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.46 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2808  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1161  protein of unknown function DUF883 ElaB  35.19 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1034  hypothetical protein  29.17 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>