14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28758 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28758  predicted protein  100 
 
 
340 aa  677    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00260  cytoplasm protein, putative  29.19 
 
 
357 aa  122  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04546  KH domain RNA-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02780)  28.37 
 
 
542 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000459967  normal  0.0749815 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62156  predicted protein  23.97 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474155  normal  0.0819638 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10257  KH domain RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04940)  33.15 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03070  cytoplasm protein, putative  27.3 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205748  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76889  PAB1 binding protein  28.31 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0374206 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  30.26 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40453  predicted protein  36.17 
 
 
297 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44729  predicted protein  22.41 
 
 
699 aa  62.8  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15661  predicted protein  26.32 
 
 
651 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47861  predicted protein  23.48 
 
 
1234 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.090651  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28250  predicted protein  29.58 
 
 
437 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.522861  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1786  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.59 
 
 
717 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.062273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>