87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1066 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1066  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1561  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.02 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0719  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.56 
 
 		 423 aa  68.6  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.380857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3896  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.52 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00266538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3608  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.59 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0465  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.53 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.71344 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0113  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, penicillin-binding protein  22.59 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0147  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.04 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00007845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1367  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.36 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1285  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.42 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0121  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.12 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2457  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacA  27.08 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1818  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.22 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1540  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.84 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2315  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.18 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000162392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1925  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0009  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.18 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0010  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.49 
 
 		 450 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00503294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2600  D,D-carboxypeptidase PBP3  23.78 
 
 		 434 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2523  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  25.4 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1842  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.89 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2798  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  23.92 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4237  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.63 
 
 		 389 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5305  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacA  25.79 
 
 		 438 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000194092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0015  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacA  25.79 
 
 		 438 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000109924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0010  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.79 
 
 		 438 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1267  Beta-lactamase  29.09 
 
 		 425 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00143172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0010  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase (D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase)  25.79 
 
 		 435 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00331881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0012  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.79 
 
 		 438 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1956  beta-lactamase  24.55 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.137056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0013  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacA  25.79 
 
 		 438 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0013  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacA  25.79 
 
 		 438 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0010  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase (D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase)  25.79 
 
 		 438 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000285778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5512  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24 
 
 		 423 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24 
 
 		 423 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0357  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.19 
 
 		 538 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0009  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.79 
 
 		 435 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00323747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3910  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.12 
 
 		 425 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5568  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24 
 
 		 423 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5518  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  23.43 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5639  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.43 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0009  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.52 
 
 		 439 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5484  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.43 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5070  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase)  23.43 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.248446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5240  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.43 
 
 		 423 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2682  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  28.57 
 
 		 455 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5087  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase)  23.43 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000098556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2879  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25 
 
 		 437 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.886259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1490  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.14 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000560019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5439  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.42 
 
 		 423 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1749  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  23.68 
 
 		 408 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2529  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.51 
 
 		 434 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0537302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2383  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.38 
 
 		 509 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000824342  hitchhiker  0.00328084 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0353  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.1 
 
 		 444 aa  48.9  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.204691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3735  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.96 
 
 		 455 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0953  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0311  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.48 
 
 		 384 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  decreased coverage  0.00122162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06980  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.26 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1220  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.14 
 
 		 501 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.518526  normal  0.391466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1381  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.14 
 
 		 496 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.302081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4073  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.82 
 
 		 476 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1160  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.32 
 
 		 499 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399226  normal  0.598301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2371  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.5 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0630465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0280  penicillin-binding protein 6  22.33 
 
 		 399 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.892374  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3537  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  24.63 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000120164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06653  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.29 
 
 		 388 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1030  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin binding protein)  22.29 
 
 		 442 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0332  penicillin-binding protein 6  23.04 
 
 		 393 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0010  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  21.11 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0267  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.33 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000362711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1813  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.52 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.333201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2017  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  20.34 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000382503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0272  penicillin-binding protein 6  22.33 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0245093  hitchhiker  0.00000225718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0272  penicillin-binding protein 6  20.43 
 
 		 384 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0746018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.92 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6593  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.55 
 
 		 506 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1254  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.15 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.814321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3489  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.29 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0596  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25 
 
 		 427 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0636  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.96 
 
 		 427 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.317162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0371  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.22 
 
 		 391 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1345  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.32 
 
 		 499 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0327  penicillin-binding transmembrane protein  21.55 
 
 		 397 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3801  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.29 
 
 		 394 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000264221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0225  penicillin-binding protein 6  21.83 
 
 		 397 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4016  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  26.19 
 
 		 428 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.00000071264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1455  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  20.99 
 
 		 381 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.670306  hitchhiker  0.00376567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>