18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2243 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2243  nitrous oxidase accessory protein  100 
 
 
455 aa  888    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.685019  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3544  parallel beta-helix repeat-containing protein  72.53 
 
 
451 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.502732  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1748  twin-arginine translocation pathway signal  73.85 
 
 
454 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2646  nitrous oxidase accessory protein  85.27 
 
 
455 aa  749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1920  twin-arginine translocation pathway signal  71.21 
 
 
450 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2030  hypothetical protein  70.55 
 
 
452 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3016  hypothetical protein  69.74 
 
 
458 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.399987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0795  hypothetical protein  44.6 
 
 
456 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0908  hypothetical protein  42.69 
 
 
449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0731349  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  30.57 
 
 
709 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.07 
 
 
594 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4755  hypothetical protein  23.49 
 
 
496 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  24.66 
 
 
420 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  24.66 
 
 
420 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  24.66 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  24.66 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  24.66 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  24.66 
 
 
420 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>