15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0837 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0837  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  173  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  30.12 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  30.12 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  28.05 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  30.49 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  28.4 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  30.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  31.51 
 
 		 93 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  27.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  27.16 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  26.74 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  29.63 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  25.58 
 
 		 88 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  25.58 
 
 		 88 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  25.58 
 
 		 88 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>