25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4886 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  100 
 
 		 707 aa  1429    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  51.17 
 
 		 709 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  54.69 
 
 		 572 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  31.12 
 
 		 714 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  29.06 
 
 		 693 aa  173  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 741 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 724 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 724 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 724 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  28.68 
 
 		 717 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  24.93 
 
 		 713 aa  124  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  25.23 
 
 		 714 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  27.78 
 
 		 721 aa  117  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  30.88 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  30.88 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  30.88 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  30.88 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  26.53 
 
 		 731 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  26.53 
 
 		 731 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  26.8 
 
 		 645 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  25.93 
 
 		 475 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.642999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>