45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4223 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  40.62 
 
 
257 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  40.49 
 
 
268 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  40.49 
 
 
240 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  55.12 
 
 
143 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  36.06 
 
 
251 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.78 
 
 
276 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  31.74 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  34.74 
 
 
222 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  28.42 
 
 
273 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  29.38 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  29.38 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  27.32 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  29.21 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  33.76 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  31.19 
 
 
266 aa  62.4  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  26.6 
 
 
434 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  32.03 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  30.11 
 
 
232 aa  58.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  26.09 
 
 
434 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  26.42 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  27.55 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  24.3 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  26.24 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  28.83 
 
 
218 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  30.07 
 
 
291 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  28.42 
 
 
258 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  29.63 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  25.7 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  25.51 
 
 
281 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  27.33 
 
 
316 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  30.39 
 
 
642 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  28.65 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  25.29 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  25.29 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25.51 
 
 
485 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  28.36 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  26.07 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3953  hypothetical protein  29.03 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.686057  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.34 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
402 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0698  hypothetical protein  25.83 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.658114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>