23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3309 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  72.88 
 
 		 121 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  64 
 
 		 127 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  37.37 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  35.35 
 
 		 120 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  33.33 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  33.67 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  33.66 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  31.71 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  35 
 
 		 127 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  34.43 
 
 		 117 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  34.69 
 
 		 129 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  36.89 
 
 		 120 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  23 
 
 		 118 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  31.4 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2367  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000559969  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  34.69 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  34.69 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  24.43 
 
 		 131 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>