23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2226 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  100 
 
 
131 aa  263  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  51.82 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  49.61 
 
 
133 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  39.52 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  38.93 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  37.69 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  36 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  39.84 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  34.4 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3130  hypothetical protein  31.09 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4036  hypothetical protein  34.4 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  hitchhiker  0.00942357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  30.48 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  29.41 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1733  hypothetical protein  33.03 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0064248  normal  0.12114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  32.05 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6890  hypothetical protein  29.63 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.011863  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  31.2 
 
 
149 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8207  TadE family protein  33.8 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857445  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  25.69 
 
 
134 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8595  TadE family protein  33.88 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.931712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  30.69 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  37.74 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  35.85 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>