32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8207 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8207  TadE family protein  100 
 
 
161 aa  324  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857445  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  32.61 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  33.1 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  31.43 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  33.85 
 
 
113 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  38.98 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  31.85 
 
 
138 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.23 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  40.32 
 
 
165 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  40.26 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  40.3 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  46.81 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  32.76 
 
 
140 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  44.68 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  40.82 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  31.58 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  38.3 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  40.82 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  30.15 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40.82 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40.82 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  34.09 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  33.33 
 
 
186 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1519  TadE-like  32.84 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  39.34 
 
 
181 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  46.15 
 
 
137 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>