14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1547 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  255  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4720  hypothetical protein  49.19 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  42.75 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  46.09 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  36.72 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  41.73 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  39.39 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  33.85 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  41.27 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  38.26 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  38.05 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4650  TadE family protein  38.28 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66939  normal  0.930826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  35.92 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  30.08 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>