14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2146 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2146  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  8.000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2987  hypothetical protein  53.47 
 
 
148 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1179  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1788  hypothetical protein  47.55 
 
 
156 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.752058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2446  hypothetical protein  28 
 
 
169 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2898  hypothetical protein  25.52 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0414  hypothetical protein  26.32 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3265  hypothetical protein  23.45 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2688  hypothetical protein  26.97 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0154843  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  30.33 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  31.68 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  24.75 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2330  cyclase/dehydrase  23.39 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0431601  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  26.76 
 
 
210 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>