36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1773 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  374  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  55.84 
 
 
166 aa  191  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  55.56 
 
 
163 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  55.56 
 
 
167 aa  184  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  54.84 
 
 
167 aa  180  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  47.1 
 
 
157 aa  160  7e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  48.05 
 
 
161 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  45.07 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  46.48 
 
 
164 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  44.37 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  44.37 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  44.37 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  44.37 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25750  hypothetical protein  44.23 
 
 
159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  44.37 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  40.62 
 
 
169 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  43.23 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  41.78 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4519  hypothetical protein  41.1 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541676  normal  0.505408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4387  hypothetical protein  41.1 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113252  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  41.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  38.31 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  37.25 
 
 
170 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  38.31 
 
 
167 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  37.01 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0017  hypothetical protein  38.67 
 
 
172 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000706359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  35.71 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  36.36 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  35.06 
 
 
170 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  35.06 
 
 
170 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  35.06 
 
 
170 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0044  hypothetical protein  33.56 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  34.07 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  32.94 
 
 
89 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.09 
 
 
852 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>