13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0014 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  96.39 
 
 
83 bp  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  89.29 
 
 
84 bp  87.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  90.62 
 
 
86 bp  79.8  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  85.54 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  88.14 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0055  tRNA-Leu  85.94 
 
 
83 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00788362  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  91.49 
 
 
84 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  91.49 
 
 
84 bp  54  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  83.33 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  89.36 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>