More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3949 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
407 aa  822    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  49.74 
 
 
421 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  43.86 
 
 
425 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  44.7 
 
 
426 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  44.19 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  42.25 
 
 
427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  42.64 
 
 
411 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  40.99 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  41.09 
 
 
422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  43.92 
 
 
426 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  41.83 
 
 
416 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  41.44 
 
 
415 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.75 
 
 
430 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  41.23 
 
 
427 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  42 
 
 
411 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  43.67 
 
 
426 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  43.18 
 
 
426 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  43.18 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  41.34 
 
 
431 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  40.35 
 
 
416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  42.93 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  42.93 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  42.93 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  40.94 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  41.6 
 
 
431 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.1 
 
 
426 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  39.85 
 
 
426 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1186  amidase, hydantoinase/carbamoylase  43.78 
 
 
412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  41.48 
 
 
421 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  41.42 
 
 
418 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.15 
 
 
428 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  41.42 
 
 
418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  41.42 
 
 
418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
427 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  41.81 
 
 
420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.16 
 
 
420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.16 
 
 
420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  40.8 
 
 
425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  40.99 
 
 
429 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  39.45 
 
 
412 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  40.91 
 
 
427 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  39.8 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  40.65 
 
 
421 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  40.55 
 
 
429 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 
418 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.55 
 
 
523 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42 
 
 
418 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.25 
 
 
412 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  39.85 
 
 
408 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  40.5 
 
 
418 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  40.59 
 
 
423 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  39 
 
 
423 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  40.4 
 
 
425 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.45 
 
 
415 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  41.13 
 
 
419 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  40 
 
 
423 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  40.4 
 
 
425 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  40.15 
 
 
416 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  41.34 
 
 
418 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  41.73 
 
 
423 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2707  allantoate amidohydrolase  39 
 
 
420 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158107  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 
425 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  40.25 
 
 
425 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.66 
 
 
418 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  38.77 
 
 
424 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  39.85 
 
 
427 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.08 
 
 
422 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  42.25 
 
 
414 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1113  allantoate amidohydrolase  38.75 
 
 
416 aa  289  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  38.73 
 
 
409 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  39.14 
 
 
420 aa  289  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3036  allantoate amidohydrolase  38.75 
 
 
417 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376517  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  38.75 
 
 
423 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  39.36 
 
 
423 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.25 
 
 
401 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  41.26 
 
 
424 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2043  allantoate amidohydrolase  37.75 
 
 
416 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.801178  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  39.33 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  39.39 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2366  allantoate amidohydrolase  38 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.291014  normal  0.850534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  39.5 
 
 
442 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0348  allantoate amidohydrolase  38.75 
 
 
415 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  38.64 
 
 
421 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0279  allantoate amidohydrolase  38.75 
 
 
415 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3291  allantoate amidohydrolase  38 
 
 
417 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17984  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3455  allantoate amidohydrolase  36.25 
 
 
409 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  38.92 
 
 
415 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  38.92 
 
 
471 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  38.44 
 
 
415 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0293  allantoate amidohydrolase  38.5 
 
 
415 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0374467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  37.75 
 
 
416 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  38.38 
 
 
421 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1461  allantoate amidohydrolase  37.75 
 
 
419 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  38.92 
 
 
459 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  38.92 
 
 
459 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0184  allantoate amidohydrolase  37.75 
 
 
419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>