34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4300 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5029  globin  47.79 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3212  globin  44.04 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00535354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1842  hypothetical protein  45.95 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2518  hypothetical protein  41.35 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1478  SEC-independent protein translocase protein TatC  40 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0898  hypothetical protein  43.69 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2305  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2690  globin  39.68 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0841  hypothetical protein  43.69 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2995  globin  37.5 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0463225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5909  globin  34.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94864  normal  0.233628 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5297  sec-independent protein translocase protein TatC  35.34 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3175  hypothetical protein  36.11 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4555  hypothetical protein  46.77 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4698  hypothetical protein  47.54 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  36.45 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4184  hypothetical protein  46.77 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5779  globin  38.81 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00168244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2064  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1574  SEC-independent protein translocase protein TatC  32.52 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.583199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0535  hypothetical protein  32.43 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.658808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.74406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4280  SEC-independent protein translocase protein TatC  32.11 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3419  hypothetical protein  40.32 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3041  truncated hemoglobin-like protein  29.84 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1565  hypothetical protein  28.85 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.809798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0754  hypothetical protein  39.06 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1715  hypothetical protein  30.36 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>