24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4150 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  89.27 
 
 		 1185 bp  1005    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4150    100 
 
 		 1234 bp  2446    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  99.5 
 
 		 531 bp  387  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  99.5 
 
 		 531 bp  387  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1652    99.5 
 
 		 336 bp  387  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1136    99.5 
 
 		 505 bp  387  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0294064  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  98.99 
 
 		 531 bp  379  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  98.99 
 
 		 531 bp  379  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  78.38 
 
 		 1236 bp  73.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3285    88.24 
 
 		 952 bp  71.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.930868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  88.24 
 
 		 959 bp  71.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2412    88.24 
 
 		 952 bp  71.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0606    88.24 
 
 		 951 bp  71.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  82.61 
 
 		 1260 bp  69.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  87.5 
 
 		 567 bp  56  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  85.71 
 
 		 531 bp  54  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  78.53 
 
 		 955 bp  54  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  85.71 
 
 		 531 bp  54  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  85.71 
 
 		 531 bp  54  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  85.71 
 
 		 531 bp  54  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  82.76 
 
 		 1215 bp  54  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  90 
 
 		 1401 bp  48.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 		 1212 bp  48.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  96.43 
 
 		 1767 bp  48.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>