135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3903 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3903  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  78.46 
 
 		 369 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  78.46 
 
 		 369 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  78.46 
 
 		 369 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  72.31 
 
 		 267 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  72.31 
 
 		 369 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  72.31 
 
 		 268 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0013  ISGsu3, transposase  72.31 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0180659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0247  ISGsu3, transposase  72.31 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.425976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2499  ISGsu3, transposase  72.31 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1266  transposase, IS4  73.85 
 
 		 340 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  65.15 
 
 		 365 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  66.15 
 
 		 405 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3062  transposase  63.08 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2168  transposase, IS4  58.46 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238923  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2105  transposase, IS4  58.46 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  51.52 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  51.52 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  51.52 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 364 aa  70.5  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3706  transposase, IS4 family protein  53.12 
 
 		 354 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0089  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0576  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78227  normal  0.0868679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0754  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0806  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1230  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1431  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1519  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1871  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.85058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1916  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2122  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.973511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2685  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235088  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3331  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3410  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3613  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3918  transposase, IS4 family protein  51.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2124  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 365 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0222  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 362 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0440  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  57.35 
 
 		 366 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  57.35 
 
 		 366 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  57.35 
 
 		 366 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  57.35 
 
 		 366 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0006  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3116  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000441936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2513  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0155  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2694  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00558684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2311  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000514015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1681  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0839  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 360 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000787198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1787  ISGsu3, transposase  47.46 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0283  transposase IS4  48.33 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1069  transposase IS4  48.33 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0456377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2091  transposase IS4  48.33 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000396436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2240  transposase IS4  48.33 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000126004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2488  transposase IS4  48.33 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2883  transposase IS4  48.33 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3283  transposase IS4  48.33 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  55.88 
 
 		 367 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  44.62 
 
 		 362 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  52.94 
 
 		 366 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  55.88 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0050  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0096  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0307  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0723  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.619399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1090  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1177  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1197  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1312  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1514  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1517  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1956  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2178  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2511  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2556  ISMca1, transposase  50 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>