90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3825 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 129 aa  256  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  91.47 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  91.47 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  91.47 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  90.7 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  90.7 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  90.7 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  90.7 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  90.7 
 
 		 124 aa  230  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  93.5 
 
 		 121 aa  222  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  88.8 
 
 		 133 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  80.47 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  80.62 
 
 		 124 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  79.69 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  79.69 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  78.29 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  78.29 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  74.6 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  81.42 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  68.25 
 
 		 124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  68.8 
 
 		 124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  68.8 
 
 		 124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  67.97 
 
 		 124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  70 
 
 		 125 aa  166  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  69.23 
 
 		 99 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  89.04 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  86.54 
 
 		 53 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  84.91 
 
 		 57 aa  87.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  80.36 
 
 		 57 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  69.81 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  87.5 
 
 		 43 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1370  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.885273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  36.84 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  31.73 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  31.07 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  29.13 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  29.13 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  29.13 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  31.31 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  31.31 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  26.73 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  26.73 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  26.73 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  30.53 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  30.53 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  28.57 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  28.57 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1646  transposase IS3/IS911 family protein  28.16 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  30.53 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  30.1 
 
 		 130 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>