17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3100 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  191  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2509  hypothetical protein  92.63 
 
 		 98 aa  174  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.386103  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1418  hypothetical protein  79.79 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.806116  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4837  hypothetical protein  79.57 
 
 		 97 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4158  hypothetical protein  79.57 
 
 		 97 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298906  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3998  hypothetical protein  79.57 
 
 		 97 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1770  hypothetical protein  75 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0664  hypothetical protein  31.11 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000106711  normal  0.0185111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0041  hypothetical protein  34.07 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2370  hypothetical protein  28.09 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1108  hypothetical protein  32.22 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3324  hypothetical protein  32.97 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0762  hypothetical protein  34.18 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.613614  normal  0.418651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03344  hypothetical protein  32.58 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0496  hypothetical protein  24.73 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2607  hypothetical protein  32.93 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>