13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1363 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  34.8 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3658  hypothetical protein  26.84 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0015  hypothetical protein  29.93 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  27.74 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  24.26 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  32.91 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  32.91 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0186  urease, gamma subunit region  23.66 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0881  hypothetical protein  27.37 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  25.6 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01456  hypothetical protein  29.52 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1648  hypothetical protein  31.62 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>