258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1263 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  100 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  96.61 
 
 
124 aa  228  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  96.61 
 
 
124 aa  228  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  96.61 
 
 
124 aa  228  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  95.76 
 
 
124 aa  227  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  95.76 
 
 
124 aa  227  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  95.76 
 
 
124 aa  227  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  95.76 
 
 
124 aa  227  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  95.76 
 
 
124 aa  227  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  93.5 
 
 
129 aa  222  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  95.69 
 
 
133 aa  221  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  87.07 
 
 
124 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  86.21 
 
 
124 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  86.21 
 
 
124 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  84.03 
 
 
124 aa  203  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  82.35 
 
 
124 aa  199  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  82.35 
 
 
124 aa  199  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  79.82 
 
 
128 aa  183  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  87.13 
 
 
109 aa  177  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  71.19 
 
 
124 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  71.19 
 
 
124 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  71.19 
 
 
124 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  71.19 
 
 
124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  72.17 
 
 
125 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  63.39 
 
 
134 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  63.39 
 
 
134 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  63.39 
 
 
134 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  63.39 
 
 
134 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 
99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  95.59 
 
 
94 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  92.31 
 
 
53 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  64.62 
 
 
71 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  87.76 
 
 
57 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  85.71 
 
 
57 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  69.81 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  36.56 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  87.5 
 
 
43 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1370  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.885273  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  32.65 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  30.61 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  30.61 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  30.61 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  30.83 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  30.83 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  32.32 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  32.32 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  32.43 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  30.61 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  32.26 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  35.35 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  32.26 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>