20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1018 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  100 
 
 
666 aa  1375    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.94 
 
 
690 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  22.47 
 
 
566 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  25 
 
 
536 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  25.18 
 
 
536 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  34.07 
 
 
412 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  27.21 
 
 
542 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  51.35 
 
 
535 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  51.35 
 
 
535 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  51.35 
 
 
535 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  51.35 
 
 
535 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  29.7 
 
 
874 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  51.16 
 
 
495 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  35.82 
 
 
345 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  32.61 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  32.37 
 
 
506 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  36.76 
 
 
514 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  30.84 
 
 
247 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  30.84 
 
 
247 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  34.43 
 
 
503 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>