23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5349 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5349  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
348 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  0.183228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0146  surface protein  43.82 
 
 
266 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9225  hypothetical protein  37.87 
 
 
532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3471  hypothetical protein  33.05 
 
 
646 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.245401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0126  hypothetical protein  42.21 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0192432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1097  hypothetical protein  35.15 
 
 
512 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4952  hypothetical protein  28.42 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.27 
 
 
633 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3396  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.47 
 
 
485 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.1 
 
 
607 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3011  cell wall anchor domain-containing protein  38.96 
 
 
604 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0165682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3108  hypothetical protein  38.96 
 
 
594 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.26 
 
 
588 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00745561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5232  hypothetical protein  29.82 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4951  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  55.32 
 
 
238 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7049  hypothetical protein  30.32 
 
 
1020 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  33.64 
 
 
2136 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  33.33 
 
 
3409 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  41.1 
 
 
2449 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  26.95 
 
 
1197 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  38.37 
 
 
598 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  29.7 
 
 
1172 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2886  putative small membrane protein  53.66 
 
 
79 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>