14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4951 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4951  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
238 aa  454  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4952  hypothetical protein  62.5 
 
 
443 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  41.44 
 
 
1198 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2886  putative small membrane protein  54.1 
 
 
79 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3471  hypothetical protein  38.24 
 
 
646 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.245401  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  34.09 
 
 
1172 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9225  hypothetical protein  52.63 
 
 
532 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4978  hypothetical protein  68.75 
 
 
54 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0275703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0146  surface protein  38.71 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  54.05 
 
 
2449 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5349  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.94 
 
 
348 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  0.183228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  60 
 
 
979 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0126  hypothetical protein  40.85 
 
 
352 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0192432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  48 
 
 
3409 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>