24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4339 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  82.5 
 
 		 120 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  78.33 
 
 		 120 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  77.5 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  74.17 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  72.5 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  73.33 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  67.23 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  62.5 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  62.5 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  65.83 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  34.55 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  39.62 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  30 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  45.76 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  30.63 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  32.23 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  30.56 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  31.67 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  36.89 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  27.35 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  30.28 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  27.55 
 
 		 272 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>