18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4235 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4235  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  800    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  34.48 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  27.82 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.790878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  21.5 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  28.81 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 575 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  27.55 
 
 		 456 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>